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Courriel : Jean-Francois.Ethier2@USherbrooke.ca

Des méthodes avancées reposant entre autres sur des serveurs terminologiques et des ontologies de référence sont indispensables pour intégrer la diversité des ressources nécessaires à la recherche translationnelle.

En représentant les concepts d'un domaine sous une forme explicite et formelle, les ontologies permettent la représentation unifiée de bases de données hétérogènes et le traitement d'informations qui nécessite d'en interpréter la sémantique. Dans ce travail, nous nous plaçons d’un point de vue « translationnel », ce qui recouvre la capacité d’intégrer des données de diverses natures, à la fois médicales (au sens de la prise en charge des patients) et de recherche, biologique et génomique en particulier, et la capacité d’améliorer et d’accélérer les flux bidirectionnels entre la recherche et la clinique.

Publications sélectionnées :

- A Unified Structural/Terminological Interoperability Framework Based on LexEVS: Application to TRANSFoRm (JAMIA 2013)
- Clinical Data Integration Model: Core Interoperability Ontology for Research Using Primary Care Data
- AMIA 2013 Panel: International perspectives on the digital infrastructure for The Learning Healthcare System
- The Cardiovascular Disease Ontology (ontologie gagnante de la compétition lors de FOIS 2014)

• Exploring social inequalities in healthcare trajectories following diagnosis of diabetes: a state sequence analysis of linked survey and administrative data
  Type de publication : Article de journaux
  Date de parution : 2022-12-01
  Hyperlien : https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-85124056492&origin=inward
• Using an ontology to derive a sharable and interoperable relational data model for heterogeneous healthcare data and various applications
  Type de publication : Article de revue
  Date de parution : 2022-06-16
  Hyperlien : http://www.thieme-connect.de/DOI/DOI?10.1055/a-1877-9498
• Adherence to diabetes clinical practice guidelines to improve prevention and treatment of cardiovascular disease in Quebec: A retrospective cohort 2017-2020.
  Type de publication : Article de journaux
  Date de parution : 2022-06-01
  Hyperlien : https://doi.org/10.1016/j.deman.2022.100053
• Using an Ontology to Derive a Sharable and Interoperable Relational Data Model for Heterogeneous Healthcare Data and Various Applications
  Type de publication : Article de journaux
  Date de parution : 2022-01-01
  Hyperlien : https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-85141392618&origin=inward
• Affordances and their ontological core
  Type de publication : Article de journaux
  Date de parution : 2022-01-01
  Hyperlien : https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-85130403053&origin=inward
• A Mereological System for Informational Templates
  Type de publication : Résumé de conférence
  Date de parution : 2022-01-01
  Hyperlien : https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-85141380454&origin=inward
• Investigating Functions in BFO from the Viewpoint of Extrinsic Dispositions
  Type de publication : Résumé de conférence
  Date de parution : 2022-01-01
  Hyperlien : https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-85141433272&origin=inward
• An informational perspective on the ontology of services
  Type de publication : Résumé de conférence
  Date de parution : 2022-01-01
  Hyperlien : https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-85141388112&origin=inward
• Towards a Unified Dispositional Framework for Realizable Entities
  Type de publication : Résumé de conférence
  Date de parution : 2021-12-23
  Hyperlien : https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-85124021936&origin=inward
• Meta-consent for the secondary use of health data within a learning health system: a qualitative study of the public’s perspective
  Type de publication : Article de journaux
  Date de parution : 2021-12-01
  Hyperlien : https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-85104019302&origin=inward
• The prescription of drug ontology 2.0 (PDRO): More than the sum of its parts
  Type de publication : Article de journaux
  Date de parution : 2021-11-01
  Hyperlien : https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-85118971387&origin=inward
• Expected clinical utility of automatable prediction models for improving palliative and end-of-life care outcomes: Toward routine decision analysis before implementation
  Type de publication : Article de journaux
  Date de parution : 2021-10-12
  Hyperlien : https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-85118598327&origin=inward
• Learning health systems: An anonymous network routing protocol
  Type de publication : Résumé de conférence
  Date de parution : 2021-06-01
  Hyperlien : https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-85110910036&origin=inward
• A sensitive data access model in support of learning health systems
  Type de publication : Article de journaux
  Date de parution : 2021-03-01
  Hyperlien : https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-85102727470&origin=inward
• Flight procedures description using semantic roles
  Type de publication : Résumé de conférence
  Date de parution : 2021-01-01
  Hyperlien : https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-85117026904&origin=inward
• Gift, Reciprocity and Learning Health Systems
  Type de publication : Article de revue
  Date de parution : 2021-01-01
  Hyperlien : https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-85103997530&origin=inward
• The counting problem of slot mereology
  Type de publication : Résumé de conférence
  Date de parution : 2021-01-01
  Hyperlien : https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-85117042861&origin=inward
• Citizens, Research Ethics Committee Members and Researchers’ Attitude Toward Information and Consent for the Secondary Use of Health Data: Implications for Research Within Learning Health Systems
  Type de publication : Article de journaux
  Date de parution : 2021-01-01
  Hyperlien : https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-85102470911&origin=inward
• Expressions, utterances and directive slots
  Type de publication : Résumé de conférence
  Date de parution : 2021-01-01
  Hyperlien : https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-85116979886&origin=inward
• An Ontological Analysis of Health Procedure Information
  Type de publication : Résumé de conférence
  Date de parution : 2021-01-01
  Hyperlien : https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-85124380976&origin=inward
• How an aggregate view of social roles meets dispositions
  Type de publication : Résumé de conférence
  Date de parution : 2021-01-01
  Hyperlien : https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-85117056308&origin=inward
• Representing Gender in Ontologies: A Dispositional Perspective
  Type de publication : Résumé de conférence
  Date de parution : 2021-01-01
  Hyperlien : https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-85124044816&origin=inward
• AppArmor for health data access control: Assessing risks and benefits
  Type de publication : Résumé de conférence
  Date de parution : 2020-12-14
  Hyperlien : https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-85100939920&origin=inward
• Citizens, research ethics committee members and researchers’ attitude toward information and consent
  Type de publication : Article de journaux
  Date de parution : 2020-12-01
  Hyperlien :
• The Mereological Structure of Informational Entities
  Type de publication : Résumé de conférence
  Date de parution : 2020-10-22
  Hyperlien : https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-85096357932&origin=inward
• The SPOR-canadian data platform: A national initiative to facilitate data rich multi-jurisdictional research
  Type de publication : Article de journaux
  Date de parution : 2020-09-01
  Hyperlien : https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-85097801130&origin=inward
• Sensitive Data Exchange Protocol Suite for Healthcare
  Type de publication : Résumé de conférence
  Date de parution : 2020-07-01
  Hyperlien : https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-85094100420&origin=inward

Lien vers PubMed